Анна, по мнению ФСБ (см. Приказ 378 2014г) СКЗИ должны иметь их сертификат.
Другое дело, какова вероятность того, что вас будет проверять ФСБ? Как коммерческую организацию, вроде не могут. Но как лицензиата по ТЗКИ вас может проверить ФСТЭК и поинтересоваться, как выполняются требования 21-го приказа. В котором, в общем-то, тоже не написано, что СЗИ должны быть сертифицированы, но вам придется доказать, что вы провели оценку соответствия ваших СКЗИ. Показать соответствующие документы, например, акт испытаний СКЗИ, заключение по результатам испытаний и т.п.